界首南站站房主体建筑架空层一层，地上二层，局部商业夹层，其中中间为候车大厅、左右两侧分别为设备和办公及辅助生活用房。建筑主体采用钢筋混凝土结构，候车大厅区域屋顶采用桁架钢结构，左右两侧辅助用房屋面形式为钢筋混凝土屋面。外立面采用玻璃幕墙、铝板幕墙装饰。站房候车室、售票厅、出站厅、地道采用灰麻石材花岗岩地面及干挂花岗岩墙面，并采用铝合金离缝条板吊顶。